Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms