Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP2Q9NS61 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms