Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
DUOX2Q9NRD8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUOX2Q9NRD8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms