Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPCPD1Q9NPB8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPCPD1Q9NPB8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms