Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRHQ9HD43 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRHQ9HD43 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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