Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNRC6CQ9HCJ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNRC6CQ9HCJ0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms