Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UPF2Q9HAU5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UPF2Q9HAU5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms