Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00597Q9H2U6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00597Q9H2U6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms