Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM3Q9BZL3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM3Q9BZL3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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