Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUS3Q9BZE2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms