Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC4A5Q9BY07 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A5Q9BY07 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms