Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms