Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF17Q9BXT8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RNF17Q9BXT8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms