Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CARD11Q9BXL7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms