Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HIRIP3Q9BW71 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIRIP3Q9BW71 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms