Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TXNDC17Q9BRA2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TXNDC17Q9BRA2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms