Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USB1Q9BQ65 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms