Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms