Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF2Q99496 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms