Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL15Q96M94 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms