Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CFAP53Q96M91 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CFAP53Q96M91 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms