Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC74BQ96LY2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC74BQ96LY2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms