Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ALPK3Q96L96 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ALPK3Q96L96 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms