Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DCHS1Q96JQ0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms