Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX11Q96FC9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX11Q96FC9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms