Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDC3Q96F86 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDC3Q96F86 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms