Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRP36Q96EU6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms