Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPRTQ96BW1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms