Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF428Q96B54 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF428Q96B54 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms