Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNRQ92752 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TNRQ92752 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNRQ92752 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNRQ92752 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNRQ92752 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNRQ92752 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNRQ92752 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms