Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP6NLQ92738 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP6NLQ92738 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms