Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY36

BBX, HMG box transcription factor BBX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBXQ8WY36 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBXQ8WY36 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms