Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MCOLN3Q8TDD5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MCOLN3Q8TDD5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms