Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC4Q8TBB5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC4Q8TBB5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms