Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM87AQ8NBN3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms