Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATG16L2Q8NAA4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG16L2Q8NAA4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms