Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms