Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AMER3Q8N944 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms