Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00612Q8N6U2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms