Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KRT28Q7Z3Y7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms