Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OTOP1Q7RTM1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms