Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R3FQ6ZSY5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms