Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED9Q6R2W3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED9Q6R2W3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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