Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL35Q6PF15 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL35Q6PF15 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms