Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSAG1Q6PB30 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms