Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMOD2Q6P5Q4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD2Q6P5Q4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms