Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDC4Q6P2E9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDC4Q6P2E9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms