Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCSD1Q6JBY9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms