Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD40Q6AI12 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD40Q6AI12 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms