Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USPL1Q5W0Q7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USPL1Q5W0Q7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms